Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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