Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
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