Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KRR1Q13601 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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