Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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NAE1Q13564 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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NAE1Q13564 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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NAE1Q13564 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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