Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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