Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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BFSP2Q13515 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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BFSP2Q13515 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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BFSP2Q13515 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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BFSP2Q13515 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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