Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms