Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms