Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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