Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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