Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1BQ13112 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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