Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms