Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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FOXC1Q12948 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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FOXC1Q12948 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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FOXC1Q12948 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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