Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXF2Q12947 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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