Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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