Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STX4Q12846 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STX4Q12846 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms