Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms