Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYRO3Q06418 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYRO3Q06418 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms