Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2BQ02880 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms