Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms