Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms