Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms