Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms