Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SORDQ00796 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SORDQ00796 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SORDQ00796 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SORDQ00796 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORDQ00796 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms