Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms