Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HBG1P69891 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HBG1P69891 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBG1P69891 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms