Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms