Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS16P62249 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS16P62249 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS16P62249 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms