Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4BP61018 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4BP61018 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB4BP61018 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB4BP61018 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms