Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVPABLB-1P60509 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms