Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms