Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAG2P55895 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAG2P55895 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAG2P55895 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAG2P55895 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAG2P55895 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAG2P55895 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAG2P55895 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAG2P55895 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms