Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFDNP55196 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFDNP55196 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFDNP55196 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFDNP55196 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms