Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP12AP54707 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms