Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRAP54198 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRAP54198 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRAP54198 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRAP54198 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRAP54198 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRAP54198 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRAP54198 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRAP54198 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRAP54198 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms