Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK4P51957 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK4P51957 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK4P51957 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms