Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCR4P51679 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCR4P51679 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCR4P51679 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCR4P51679 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCR4P51679 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCR4P51679 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCR4P51679 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCR4P51679 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms