Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPIAP49247 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPIAP49247 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPIAP49247 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPIAP49247 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPIAP49247 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPIAP49247 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms