Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms