Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms