Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSN1S1P47710 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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