Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms