Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms