Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPB2P35606 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPB2P35606 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPB2P35606 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPB2P35606 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPB2P35606 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms