Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 KIZ-AS1-202ENST00000443753 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC004816.1-202ENST00000557691 629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD11P31277 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms