Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC13P31276 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms