Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLD1P28340 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLD1P28340 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLD1P28340 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLD1P28340 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLD1P28340 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLD1P28340 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLD1P28340 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLD1P28340 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms