Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PEX2P28328 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms