Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA5P28066 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms