Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR4P22455 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FGFR4P22455 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGFR4P22455 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms